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1、区别一：科属不同首先黄鳝和泥鳅的科属不同，黄鳝属于动物界合鳃鱼目、合鳃鱼科、黄鳝亚科、黄鳝属鱼类，而泥鳅为动物界鲤形目、鲤亚目、鳅科、花鳅亚科、泥鳅属鱼类。
2、区别二：形态不同黄鳝和泥鳅形态不一样，黄鳝体长偏大，头长而圆，外形细长呈蛇形，体前圆后部侧扁尾尖细，头部明显比身体略粗，且口大端位，上颌稍突出，唇颇发达，而泥鳅形体小细长，外形为长圆柱形，尾部侧扁，口下位呈马蹄形，体背及背侧灰黑色并有黑色小斑点，背鳍和尾鳍膜上的斑点排列成行，一个简单的辨别方法是泥鳅嘴尖有胡子尾巴宽，黄鳝头大没有胡子尾巴尖。
3、区别三：分布不同黄鳝和泥鳅的分布不同，黄鳝广泛分布于全国各地的湖泊、河流、水库、池沼、沟渠等水体中，主要以珠江流域和长江流域地区为主，国外主要分布于泰国、印度尼西亚、菲律宾等地，而泥鳅在中国分布更广泛，除青藏高原和西藏林芝地区外，全国各地水田、池塘、湖泊和水库等天然淡水水域中几乎均有分布，主要以长江和珠江流域中下游为主。
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